Çevre mühendisliği laboratuvarı ekolojinin ana konuları üzerinde pratik çalışmalar yürütmektedir. Laboratuvarın alanı 87,7 m2 olup, toplam 30 öğrenciye hizmet verebilmektedir. Laboratuvar, bileşimlerindeki bazı metallerin tayini de dahil olmak üzere su ve toprak kalitesi analizleri yapmaktadır. Laboratuvar aşağıdaki ekipmanlarla donatılmıştır: Su damıtma ekipmanı GFL Tip: 2204, Santrifüj HERAEUS laborfuge 400, BCM tespit ekipmanı OXITOP BOX, OC 100, Su banyoları HAAKE V26 ve SWB 25, Spektrofotometre CADAS 50 S, Mech. karıştırıcı HEİDOLPH, RZR 2021, nem ölçüm ekipmanı OHAUS MB200, dijital titratörler Titroline 96 ve AMA DIGIT AD 14th, vakum pompası SARTORIUS AG 16612, mufla fırını Naberhherm L3/11/S27, kurutma dolabı WTC BINDER ED 115.
