В соответствии со статьей 7 Договора о дальнейшей деятельности Кыргызско-Турецкого университета "Манас" от 26 апреля 2011 года учебная, административная и финансовая деятельность университета, а также финансовые расходы и другие виды деятельности Попечительского совета контролируются Ревизионной комиссией. Ревизионная комиссия состоит из 8 человек по 4 человека с кыргызской и турецкой сторон. Члены Ревизионной комиссии с кыргызской стороны назначаются постановлением Правительства Кыргызской Республики. Председатель Ревизионной комиссии назначается из числа членов комиссии по взаимному согласованию сторон сроком на 2 года поочередно с каждой стороны. Срок полномочий членов Ревизионной комиссии 5 (пять) лет.
Проф., док. Нажи Гундоган
председатель Ревизионной комиссии,
член исполнительного совета высшего образования Турецкой Республики
Жибек Дуйшеева
член Ревизионной комиссии,
заместитель министра финансов
Проф., док. Рахми Эр
член Ревизионной комиссии,
член Совета по высшему образованию Турецкой Республики
Проф., док. Абылабек Асанканов
член Ревизионной комиссии,
член-корреспондент Национальной академии наук Кыргызской Республики
Проф., док. Метин Топжуоглу
член Ревизионной комиссии,
заместитель председателя Совета по высшему образованию Турецкой Республики/Член исполнительного совета
Проф., док. Төлөбек Абдырахманов
член Ревизионной комиссии,
ректор КНУ им. Ж.Баласагына
Исмаил Эраслан
член Ревизионной комиссии,
начальник управления стратегического планирования Министерства финансов Турецкой Республики
Салмарбек Асанов
член Ревизионной комиссии,
главный специалист управления бюджетной политики, финансового анализа и инвестиций Министерства образования и науки Кыргызской Республики