В соответствии со статьей 12 Устава Кыргызско-Турецкого университета «Манас» Совет управления является органом университета, который рассматривает и принимает решения по административной и финансовой деятельности университета. Подробный перечень обязанностей Совета управления излагается в статье 12 Устава университета.

В 2023/2024 учебном году состав Совета управления университета следующий:

PhD. проф. Жейлан Алпаслан

Ректор

Кандидат политических наук, доцент Ибраев Алмаз 

Первый проректор

PhD. проф. Ашык Алпаслан

И.о. Декана Гуманитарного факультета

д.б.н. проф. Курманбекова Гулбубу

И. о. Декана факультета Естественных наук

PhD..проф. Гулбейаз Куршад

И. о. Декана факультета Искусств

PhD. проф. Озер Гёкхан

И. о. Декана факультета Экономики и Управления

PhD. проф. Айык Хасан

И. о. Декана факультета Теологии

PhD. доц. Унал Угур

И. о. Декана факультета Коммуникации

к.б.н. доц. Тотубаева Нурзат

И. о. Декана Инженерного факультета

к.п.н. проф. Джанузаков Канат

И. о. Декана факультета Спортивной науки

PhD. проф. Бойлу Йасин

И. о. Декана факультета Туризма

PhD. проф. Шен Исмаил

И. о. Декана Ветеринарного факультета

PhD. проф. Айгун Ахмет

И. о. Декана Сельскохозяйственного факультета

PhD. проф. Ардыч Кадир

PhD. проф. Турдуев Мирбек 

д.ф.н. проф. Сагынбаева Бурул

д. в. н. проф. Тулобаев Аскарбек

PhD. проф. Доган Режаи 

Жейда Тугче Акдоган

И.о. генерального секретаря - Секретарь совета