В соответствии со статьей 12 Устава Кыргызско-Турецкого университета «Манас» Совет управления является органом университета, который рассматривает и принимает решения по административной и финансовой деятельности университета. Подробный перечень обязанностей Совета управления излагается в статье 12 Устава университета.

В 2026/2027 учебном году состав Совета управления университета следующий:

PhD. проф. Жейлан Алпаслан

Ректор

Кандидат политических наук, доцент Ибраев Алмаз 

Первый проректор

PhD. проф. Ашык Алпаслан

И.о. Декана Гуманитарного факультета

д.б.н. проф. Курманбекова Гулбубу

И. о. Декана факультета Естественных наук

PhD..проф. Джейлан Алпаслан

Декан факультета Искусств

PhD. проф. Карымшаков Камалбек

И. о. Декана факультета Экономики и Управления

PhD. проф. Акюз Хүсеин

И. о. Декана факультета Теологии

PhD. проф. Йылдырым Бесим

И. о. Декана факультета Коммуникации

PhD. проф. Исмаилова Рита

И. о. Декана Инженерного факультета

к.б.н. проф. Абдырахманова Джипаркуль 

И. о. Декана факультета Спортивной науки

PhD. проф. Кыдыралиев Нурудин

И. о. Декана факультета Туризма

PhD. проф. Алтынташ Исмет

Декан медицинского факультета

PhD. проф. Шен Исмаил

И. о. Декана Ветеринарного факультета

PhD. проф. Джейлан Алпаслан

Декан Сельскохозяйственного факультета

PhD. проф. Ардыч Кадир

PhD. проф. Турдуев Мирбек 

PhD. проф. Челик Эржан 

д. в. н. проф. Тулобаев Аскарбек

PhD. Доц. Фатих Рамазан Истанбуллугил

Генеральный секретарь - Секретарь совета