В соответствии со статьей 9 Устава Кыргызско-Турецкого университета «Манас» Ученый совет является академическим органом университета и принимает решения по учебной и научной деятельности университета. Подробный перечень обязанностей Ученого совета излагается в статье 10 Устава университета.

В 2023/2024 учебном году состав Ученого совета университета следующий:

PhD. проф. Жейлан Алпаслан

Ректор

Кандидат политических наук, доцент Ибраев Алмаз 

Первый проректор

PhD. проф. Карымшаков Камалбек

Проректор

PhD. проф. Доган Режаи

Проректор

PhD. проф. Ашык Алпаслан

И.о. Декана Гуманитарного факультета

д.б.н. проф. Курманбекова Гулбубу

И. о. Декана факультета Естественных наук

PhD. проф. Гулбейаз Куршад

И. о. Декана факультета Искусств

PhD. проф. Озер Гёкхан

И. о. Декана факультета Экономики и Управления

PhD. проф. Айык Хасан

И. о. Декана факультета Теологии

PhD. доц. Унал Угур

И. о. Декана факультета Коммуникации

к.б.н. доц. Тотубаева Нурзат

И. о. Декана Инженерного факультета

к.п.н. проф. Джанузаков Канат

И. о. Декана факультета Спортивной науки

PhD. проф. Бойлу Йасин

И. о. Декана факультета Туризма

PhD. проф. Шен Исмаил

И. о. Декана Ветеринарного факультета

PhD. проф. Айгун Ахмет

И. о. Декана Сельскохозяйственного факультета

PhD. проф. Ардыч Кадир

Директор института послевузовского образования

PhD. проф. Доган Режаи

И. о. Директора высшей школы Иностранных языков

PhD. и.о. доц. Вурал Махмут

И. о. Директора Профессионально-технической школы

д.ф.н. проф. Сагынбаева Бурул

PhD. проф. Челик Эржан

PhD. доц. Нажимудинова Сейил 

PhD. проф. Полат Кемал

PhD. доц. Акман Эрдоган

к.т.н. проф. Боркоев Бакыт

PhD. проф. Демирхан Билал

PhD. проф. Кыдыралиев Нурудин

PhD. проф. Шахин Митат

PhD. и. о. доц. Таир Эсенали уулу

Жейда Тугче Акдоган

И.о. генерального секретаря - Ученый секретарь

Представитель студентов