В соответствии со статьей 9 Устава Кыргызско-Турецкого университета «Манас» Ученый совет является академическим органом университета и принимает решения по учебной и научной деятельности университета. Подробный перечень обязанностей Ученого совета излагается в статье 10 Устава университета.

В 2024/2025 учебном году состав Ученого совета университета следующий:

PhD. проф. Жейлан Алпаслан

Ректор

Кандидат политических наук, доцент Ибраев Алмаз 

Первый проректор

PhD. проф. Алтынташ Исмет

Проректор

PhD. проф. Карымшаков Камалбек

Проректор

PhD. проф. Ашык Алпаслан

И.о. Декана Гуманитарного факультета

д.б.н. проф. Курманбекова Гулбубу

И. о. Декана факультета Естественных наук

PhD. проф. Озкаржы Мехмет

И. о. Декана факультета Искусств

PhD. проф. Карымшаков Камалбек

И. о. Декана факультета Экономики и Управления

Кандидат политических наук, доцент Ибраев Алмаз 

И. о. Декана факультета Теологии

PhD. проф. Жейлан Алпаслан

И. о. Декана факультета Коммуникации

к.б.н. доц. Тотубаева Нурзат

И. о. Декана Инженерного факультета

к.б.н. проф. Абдырахманова Джипаркуль 

И. о. Декана факультета Спортивной науки

PhD. проф. Жейлан Алпаслан

И. о. Декана факультета Туризма

PhD. проф. Шен Исмаил

И. о. Декана Ветеринарного факультета

PhD. проф. Айгун Ахмет

И. о. Декана Сельскохозяйственного факультета

PhD. проф. Ардыч Кадир

Директор института послевузовского образования

Вайсканова Салия

И. о. Директора высшей школы Иностранных языков

PhD. проф. Турдуев Мирбек

И. о. Директора Профессионально-технической школы

д.ф.н. проф. Сагынбаева Бурул

PhD. проф. Челик Эржан

PhD. доц. Нажимудинова Сейил 

PhD. проф. Полат Кемал

PhD. доц. Акман Эрдоган

к.т.н. проф. Боркоев Бакыт

PhD. проф. Демирхан Билал

PhD. проф. Кыдыралиев Нурудин

PhD. проф. Шахин Митат

PhD. и. о. доц. Эсенали уулу Таир 

Ст. преп. Жанапилов Адилет

PhD. и.о.доц. Фатих Рамазан Истанбуллугил

Генеральный секретарь - Ученый секретарь

Представитель студентов