Кыргызско-Турецкий университет «Манас» начал образовательную деятельность в 1997-1998 учебном году в здании, расположенному по адресу г. Бишкек, пр. Манаса № 16. До 1998 года регистрация и учет зачисленных студентов осуществлялись под руководством проректора Салижана Жигитова.
В 1998 году был образован студенческий отдел, который непосредственно стал заниматься вопросами регистрации и учета студентов. 13 декабря 1998 года университет переехал в новое здание по адресу г. Бишкек, пр. Мира № 56, в котором студенческий отдел продолжил свою работу до 2004 года.
С 2004 года студенческий отдел ведет свою деятельность на 1-ом этаже в здании факультета экономики и управления, который находится в мкр. Джал на территории университетского кампуса им. Чынгыза Айтматова.
Централизованно налаженная работа студенческого отдела позволяет быстро и эффективно решать вопросы и задачи студентов.