1997-1998 Eğitim-Öğretim Yılında, ilk öğrencileri kabul eden Üniversitemiz eğitim-öğretim faaliyetlerine Manas Caddesi 16 numarada bulunan binada başlamıştır. Üniversiteye kabul edilen öğrencilerin işlemleri 1998 yılına kadar Rektör Yardımcısı Salican CİGİTOV’a bağlı olarak yürütülmüştür.
1998 yılında Öğrenci İşleri Müdürlüğü ihdas edilerek öğrenci işlemleri yürütülmeye başlanmıştır. Üniversitenin 13 Aralık 1998 tarihinde Tınçtık Caddesi-56 numaralı binaya taşınması ile birlikte Öğrenci İşleri Müdürlüğü, faaliyetlerini burada sürdürmeye devam etmiştir.
2000-2001 Eğitim Öğretim Yılına kadar faaliyetlerini Müdürlük olarak sürdüren Öğrenci İşleri bu eğitim öğretim yılından itibaren Öğrenci İşleri Dairesi Başkanlığına dönüştürülmüştür.
2004 yılına kadar halen Rektörlük Merkez Binası olarak kullanılmakta olan binada faaliyetlerini sürdürmüş olan Öğrenci İşleri Dairesi Başkanlığı, 2004 yılında Üniversitenin Cal/Cengiz Aytmatov Kampüsündeki İktisadi ve İdari Bilimler Fakültesi Binasının 1. Katındaki ofislerine taşınmıştır.
Öğrenci İşleri Dairesi Başkanlığı, faaliyetlerini merkezi olarak sürdürmektedir.