Mikrobiyoloji laboratuvarı, gıda ürünlerindeki patojenik ve hijyenik gösterge mikroorganizmalarını analiz etmek ve fermente gıdaların üretimi için gerekli mikroorganizmaları elde etmek için cihazlarla donatılmıştır. Mikrobiyoloji laboratuvarı, 1. sınıftan itibaren zorunlu bir ders olarak programa dahil edilmiştir. Öğrenciler, ham ve hazır ürünlerdeki mikrobiyolojik göstergeleri belirler, mikrobiyolojik araştırmalar üzerine çeşitli bilimsel projeler yürütürler.
