Kırgızistan-Türkiye Manas Üniversitesi 6 Ağustos 1996 tarih ve 22719 sayılı T.C. Resmi Gazete'de yayımlanan 96/8350 sayılı Milletlerarası Anlaşma uyarınca kurulmuş özel statüye sahip bir yüksek öğretim kurumudur. Üniversitenin genel yönetimi, ortak işletme-ortak idare prensibinden hareketle, taraf hükümetlerce atanan sekiz kişiden müteşekkil bir Mütevelli Heyet tarafından yürütülmektedir. Heyet Başkanı ve üç üye Türkiye Cumhuriyeti Hükümeti tarafından müşterek kararname ile atanmakta, Heyet'in diğer dört üyesi ise Kırgız Eğitim ve Bilim Bakanlığı'nın teklifi üzerine Kırgız Cumhuriyeti Hükümeti tarafından cari usullere göre tayin edilmektedir.

Prof. Dr. Fahrettin ALTUN

Mütevelli Heyet Başkanı,

Türkiye Cumhuriyeti Cumhurbaşkanlığı İletişim Başkanı

Rasul ABAZBEK UULU

Mütevelli Heyet Üyesi,

Kırgız Cumhuriyeti Eğitim ve Bilim Bakan Yardımcısı

İbrahim ŞENEL

Mütevelli Heyet Üyesi,

Türkiye Cumhuriyeti Cumhurbaşkanlığı Strateji ve Bütçe Başkanı

Aybek MOLDOGAZİYEV

Mütevelli Heyet Üyesi,

Kırgız Cumhuriyeti Dışişleri Bakan Yardımcısı

Prof. Dr. Halim Haldun GÖKTAŞ

Mütevelli Heyet Üyesi,

YÖK Başkan Vekili / Yürütme Kurulu Üyesi

Talgat AŞİRBEKOV

Mütevelli Heyet Üyesi,

Kırgız Cumhuriyeti Cumhurbaşkanlığı İdaresi Dış Politika Dairesi Başkan Yardımcısı

Azamat ŞARŞEEV

Mütevelli Heyet Üyesi,

K. C. Cumhurbaşkanı Kırgız Cumhuriyeti Cumhurbaşkanı İdaresi Ağ Politikası Dairesi Başkan Yardımcısı